输尿管硬镜和软镜的伤害大小，不能够进行准确的区分，因为两者手术的部位不同。一般需要根据患者输尿管结石的具体情况选择合适的手术方式，可以将伤害降至最小。
输尿管硬镜因为材质比较硬，主要用于取出输尿管中段、下段的结石。输尿管软镜主要用于取出输尿管上段的结石，同时还可以处理肾脏内的结石。根据患者输尿管结石所在的部位，选择相应的手术方式，可将手术对人体的伤害降至最低。
输尿管硬镜在手术后可能会导致患者出现疼痛、血尿、发热、输尿管损伤等伤害。输尿管软镜取石过程中，可能会导致患者出现逆行感染、输尿管黏膜损伤的情况。所以两种手术类型并不能准确的判断哪个伤害比较大。