孕晚期尿道口刺痛，有可能是生理因素或者疾病因素引起的，具体如下：
一、生理因素。
在怀孕晚期，由于胎头逐渐地压迫到膀胱部位，就可能会对膀胱造成一定的刺激，从而出现尿频、尿急、尿失禁，以及尿道口刺痛的感觉，这种情况属于正常的生理性现象，一般不需要特殊处理。
二、病理因素。
1、尿道炎。当尿道外周围的细菌数量增加、孕妇自身的免疫力减弱时，就可能会导致病菌由尿道外口进入到尿道，引起尿道炎。建议多喝水，增加排尿量，大部分细菌会随着尿液排出体外。如果症状比较严重时，则可以遵医嘱口服消炎药治疗，如左氧氟沙星、阿奇霉素等。
2、阴道炎。阴道炎主要是由于受到滴虫、细菌、真菌感染引起的。在通过检查确定病因后，可遵医嘱使用甲硝唑，左氧氟沙星等药物来进行对症治疗。孕妇出现阴道炎后，建议不要抓挠，可以用热水擦洗，勤换内裤，内裤每日烫煮或太阳暴晒，避免重复感染。平时要注意卫生，保护好阴道部位，减少细菌感染的机会。