自身免疫性肝病抗体检测查的是抗线粒体抗体、抗肝细胞溶质抗原I型抗体、抗核抗体、抗平滑肌抗体等抗体。
1、抗线粒体抗体。抗线粒体抗体存在于患者的血清中，通过间接免疫荧光法测出该抗体结果为阴性时，可与其他指标结合诊断患者是否有自身免疫性肝病，比如抗肝肾微粒体I型抗体、抗肝细胞胞质1型抗体。
2、抗肝细胞溶质抗原I型抗体。为诊断自身免疫性肝病的标记性抗体，如果其检查结果为阳性，很大程度上患者可能有自身免疫性肝病。
3、抗核抗体。抗核抗体多存在于IgG中，可用于诊断患者是否有自身免疫性疾病，其正常值需小于32。
4、抗平滑肌抗体。抗平滑肌抗体的滴度小于1:10的时候，结果为阴性，大于1:10的时候为阳性，可用于鉴别自身免疫性肝病。