打了两针黄体酮月经还不来可能是停药时间短引起，但也不排除是早发性卵巢功能不全、怀孕等原因导致。
1、停药时间短：一般注射完黄体酮之后并不会马上就来月经，通常需要停药三到七天左右，月经才会正常来潮，所以打两针黄体酮月经还不来可能是因为是药物还没有发挥效果导致的。
2、早发性卵巢功能不全：如果女性的卵巢已经失去正常的功能，身体内的雌激素水平也会有所下降，在雌激素水平过低的情况下，即使注射黄体酮药物，也可能起不到促使月经来潮的作用，因此会出现打了两针黄体酮月经还不来的情况。
3、怀孕：育龄期的女性如果停药八天以后仍然不来月经，就要警惕和怀孕有关，建议尽早到医院进行血HCG检查。