深夜肚子疼拉稀完后舒服一点可能是饮食因素，也可能是肠易激综合征等原因引起的。
1、饮食因素：可能是因为睡觉之前摄入较多生冷，或者刺激性的食物，这些食物可能会导致肠蠕动明显增快，所以会出现深夜肚子疼拉稀完后舒服一点。一般要改善不良的饮食习惯，晚上尽量以清淡、易消化的食物为主，还要注意少食多餐，避免暴饮暴食。
2、肠易激综合征：可能是由肠道感染、遗传因素、食物因素等原因导致。由于胃肠道蠕动比较快，导致排便习惯发生改变，所以会出现深夜肚子疼拉稀完后舒服一点。一般可在医生的指导下给予止泻的药物治疗，比如盐酸洛哌丁胺胶囊、蒙脱石散等，出现腹部疼痛症状时，还可以给予丁溴东莨菪碱胶囊治疗。