腘窝囊肿可以采取一般治疗、药物治疗、手术治疗。
1、一般治疗：首先需要患者多注意休息，避免长时间站立或者行走，且在休息的过程中可以适当将患肢抬高，有利于促进血液回流，缓解临床症状。必要时也可通过穿刺抽液的方法缓解压力，减轻症状。
2、药物治疗：如果腘窝囊肿引起明显的疼痛，可以在医生指导下使用注射用头孢曲松钠、注射用甲泼尼龙琥珀酸钠等药物治疗，可以促使炎症消失，缓解疼痛症状。
3、手术治疗：如果腘窝囊肿引起剧烈的疼痛或者出现压迫症状，以及通过以上方法无法改善时，也可以采取传统开放切除手术、关节镜手术将其切除。但在术后还要配合阿莫西林胶囊、阿奇霉素片等药物进行预防感染治疗。