骨性地包天可能是遗传因素、不良口腔习惯、骨骼代谢紊乱等造成的。
1、遗传因素：正常情况下，牙齿的咬合关系是上牙覆盖住下牙，如果是牙齿原因引起的下牙覆盖住上牙，就称为是骨性地包天。如果家族当中的直系亲属患有骨性地包天，受到遗传因素的影响，其子女发生骨性地包天的几率会比正常人要高很多。
2、不良口腔习惯：如果从小就有咬嘴唇、咬手指或咬其他东西的习惯，这些不良习惯都可能会导致上前牙内凹，使下前牙外突，从而会形成骨性地包天。
3、骨骼代谢紊乱：如果本身患有佝偻病、垂体功能亢进等疾病，这些都可能会影响到机体的钙磷代谢，导致骨骼代谢紊乱，影响到下颌的发育，因此会出现骨性地包天。