肩膀右侧上方肌肉酸痛可能是肩袖损伤、肩周炎、颈椎病等原因引起的，需要查明病因后针对性进行治疗。
1、肩袖损伤：可能是因为间接暴力或者是慢性劳损等原因所致，当患者摔倒时用手撑地或者是长时间用肩膀搬抬重物时，可能会造成肩袖损伤，导致肩膀右侧上方肌肉酸痛。患者需要注意多休息，同时使用外展架或者石膏外固定对患侧肩膀进行固定，促使肩袖损伤的恢复。保守治疗无效时应进行手术治疗，比如关节镜手术、开放手术等。
2、肩周炎：如果患者长时间缺乏活动，关节可能会变得僵硬，这时在天气寒冷时容易受到冷风刺激引起无菌性炎症，造成肩膀右侧上方肌肉酸痛。患者在急性期发作时可使用冰袋来冰敷，缓解肩膀不适，也可采取爬墙法、画圈法等锻炼方法。必要时遵医嘱口服非甾体抗炎镇痛药物，比如依托考昔片、布洛芬缓释片等，能够减轻炎症、肿胀。
3、颈椎病：若患者长期伏案工作，可能会造成颈椎劳损或者是椎间盘脱出，致使脊髓、神经根等部位受压，累及神经根时可能会放射至肩膀右侧上方，导致肩膀右侧上方肌肉酸痛。患者要避免长时间低头，可以适当游泳来锻炼肩颈肌肉，同时可遵医嘱服用氯唑沙宗片、盐酸乙哌立松片等，改善肌肉松弛。症状严重时应采取前路手术、后路手术等手术方法来治疗。