头痛喉咙痛咳嗽考虑与上呼吸道感染、鼻炎、胃食管反流病等原因有关。
1、上呼吸道感染：当机体过度劳累或者受凉时，很容易受到细菌或病毒的感染，而引起上呼吸道感染。由于细菌、病毒侵袭机体的中枢神经，可引起头痛的症状。且会影响咽喉部黏膜，出现局部充血、肿胀，而表现为头痛、喉咙痛、咳嗽的症状。
2、鼻炎：如果长期接触花粉、尘螨等致敏物质，或者因机体缺乏维生素，都有可能会诱发鼻炎。因炎症刺激，可出现鼻塞、流鼻涕、打喷嚏等症状。当鼻涕发生鼻后滴漏的表现时，可刺激咽喉部的黏膜出现充血、水肿，而发生喉咙痛咳嗽的症状。而鼻塞症状可能会引起大脑供血供氧不足，而出现头痛的现象。
3、胃食管反流病：若长期处于紧张、焦虑的状态，或者过多吃高脂肪的食物，很容易诱发胃食管反流病。临床症状主要表现为反酸、烧心。当反流物反流至咽喉部黏膜时，可出现喉咙痛咳嗽的症状。且疾病还可能会影响到植物神经功能，而出现头痛的症状。