沙门氏菌和大肠杆菌的区别在于发病机制不同、细菌类型不同、临床症状不同。
1、发病机制不同：沙门氏菌主要是因为摄入携带有沙门氏菌的食物，病原微生物在机体内大量繁殖而发生的感染。大肠杆菌是因为人体吃了不干净的食物或者是本身的大肠杆菌超标，导致机体出现各种类型的感染症状。
2、细菌类型不同：沙门氏菌有会寄生在人体内，但也有可能会寄生在动物的肠道内，因此沙门氏菌属于肠道致病菌。大肠杆菌通常是积存在人体内，但也会寄存在自来水当中，属于一种条件致病菌。
3、临床症状不同：感染沙门氏菌后会出现高热、腹泻等症状，而且大便的颜色也会发生明显的改变，出现黄色或者是绿色的稀便，严重时还会引起败血症。感染大肠杆菌后通常会出现呕吐、腹泻、排便困难等症状。