运动后肌肉痛三天了考虑与乳酸堆积、肌肉拉伤、筋膜炎等有关。
1、乳酸堆积：如果平时运动量比较少，或者是突然做了大量的运动，可能会导致身体内产生的乳酸，短时间无法分解为水和二氧化碳，乳酸在身体内堆积会引起疼痛，这种情况一般不需要特殊处理，可以适当热敷改善，一般会逐渐消失。
2、肌肉拉伤：如果在运动的过程中运动幅度太大，会对肌肉造成损伤，如果只是轻度的拉伤，可以通过休息缓解，疼痛明显时可以选择非甾体类的抗炎药物，比如布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等。
3、筋膜炎：如果患者本身存在筋膜炎，在剧烈运动以后会加重症状引起疼痛，可以适当进行拉伸训练，放松此处的肌肉，还可以配合一些物理的疗法，比如热疗、微波治疗等，疼痛明显的患者，可以口服塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物，如果存在肌肉痉挛，可以使用盐酸乙哌立松片、盐酸替扎尼定片等药物。
运动后肌肉痛三天了也可能是外伤引起的，患者应该及时就诊，明确原因以后规范治疗，使用以上药物时都要严格遵医嘱使用。