低密度脂蛋白胆固醇偏低存在一定的危害性，常见于营养不良、甲状腺功能亢进症、肝硬化等。
1、营养不良：一般是因为过度挑食、偏食，导致体内蛋白质合成减少造成的。如果是轻度营养不良，危害相对比较小，主要会引起轻微的头晕、乏力。但如果属于重度营养不良，其危害相对比较大，会影响儿童生长发育，或严重影响机体脏器功能，出现心跳无力、脉搏薄弱、呼吸困难等不适。
2、甲状腺功能亢进症：通常是因为体内甲状腺激素分泌过多引起，由于疾病使身体内所有物质代谢处于过度状态，因此会发生低密度脂蛋白胆固醇偏低的情况。若治疗不及时，可造成身体消瘦、突眼，或诱发甲亢性心脏病、甲亢危象等情况。
3、肝硬化：一般是因为肝功能严重受损，造成胆固醇功能发生异常而出现数值偏低，通常会严重影响患者的生活质量，如引起肝功能衰竭和各种并发症，包括腹水、食管胃底静脉曲张破裂出血等。
除此之外，若患者出现恶性肿瘤，也会出现此数值偏低，并对身体健康造成危害。