咳嗽肩胛骨疼可能是肌肉拉伤、韧带拉伤、肩周炎等原因引起。
1、肌肉拉伤：如果短时间内进行剧烈的运动，且没有做热身动作，可能会使肩膀部位的肌肉被过度牵拉，导致肌肉以及肌腱组织发生断裂，咳嗽的过程当中会对局部造成牵拉，诱发疼痛或者是活动受限等症状。
2、韧带拉伤：当肩关节部位的活动超出机体所承受的范围时，会对韧带组织造成明显的牵拉，诱发韧带部分断裂或者是全部断裂，咳嗽时会直接震动肩胛骨部位的肌肉组织，诱发疼痛症状。
3、肩周炎：可能是急性损伤或者是慢性劳损，导致肩周部位的组织出现炎症反应，炎性因子渗出过多，会对周围的组织造成刺激，诱发肿胀，而患者做咳嗽动作时，会对肩胛骨部位造成一定的牵拉，引起钝痛、刺痛等症状。
另外，也不排除是颈椎病引起的，需要及时前往医院的骨科完善相关检查。