发烧39度通常指的是发热39℃。幼儿发热39℃退热需要根据病因进行分析，常见的病因有上呼吸道感染、流行性感冒、胃肠炎等。
1、上呼吸道感染：是由病毒、细菌进入呼吸道内大量繁殖并释放内源性致热物质使体温上升，还会引起打喷嚏、咽痛。建议针对病原体治疗，比如细菌感染，可遵医嘱使用阿奇霉素颗粒、头孢呋辛酯颗粒、头孢克肟颗粒等药物，还可以使用对乙酰氨基酚口服溶液、布洛芬颗粒等药物帮助退热。
2、流行性感冒：幼儿如果受到病毒感染，会使机体产生免疫物质，导致体温上升、干咳、肌肉酸痛等。建议遵医嘱使用抗病毒药物，常见的药物有阿昔洛韦颗粒、磷酸奥司他韦颗粒、利巴韦林颗粒等。
3、胃肠炎：病原微生物在胃肠内繁殖并释放有毒物质，使机体免疫系统开启防御作用吞噬病原微生物，使身体出现内源性致热源，导致体温上升、恶心、呕吐等。可在医生的指导下使用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚口服溶液，还可使用乳酶生片、枯草杆菌二联活菌颗粒等调节菌群，同时退热。
除此之外，扁桃体炎、中耳炎、肺炎等也可能会引起发热39℃，建议到医院的儿科就诊，根据医生要求选择针对性治疗。