小肉疣出现的原因，一般需要根据疣的类型进行分析，比较常见的包括传染性软疣、扁平疣、跖疣等。
1、传染性软疣：如果身体直接接触，或者在公共游泳池中被传染软疣病毒，可能会因为病毒感染皮肤和黏膜上的角质细胞以及粘液细胞，引起细胞增殖和异常分化，出现传染性软疣表现为小肉瘤。可以在医生的指导下通过使用咪喹莫特乳膏、斑蝥素乳膏、阿昔洛韦乳膏等药物涂抹，帮助清除皮损，使其消退。
2、扁平疣：可能是皮肤出现破损以后，人乳头瘤病毒通过伤口进入上皮感染表皮细胞，并复制增殖，引起上皮细胞增生和角化过度导致，这些增生细胞在一起会形成表面扁平凸起的小肉疙瘩。可以遵医嘱使用维A酸类药物，促进上皮细胞分化以及增长，抑制角化过度和皮脂分泌改善症状，常用药物包括维A酸乳膏、阿达帕林凝胶、异维A酸凝胶等。
3、跖疣：可能是足部出现外伤或者长期受到摩擦，出现皮肤破损以后感染人乳头瘤病毒，病毒侵入表皮细胞出现异常分化增生，形成皮肤良性增生物，表现为皮肤出现与肤色一样的隆起状组织。一般可以在医生的指导下，通过使用水杨酸类药物，常用药物包括水杨酸乳膏、尿素乳膏、复方水杨酸冰片软膏等，破坏疣体抑制局部表皮生长，刺激局部或者全身免疫反应，使病情缓解。
此外，如果出现尖锐湿疣、寻常疣也可能会引起上述现象。建议患者积极就医，根据病情的严重程度，选择合适的方式进行缓解。