吃皮蛋舌头两边疼可能是非疾病因素引起，也可能是疾病因素导致，比如过敏、细菌感染等。
一、非疾病因素
皮蛋属于一种酸性食品，如果再配上其他酸性食物和饮料一起食用，会对口腔黏膜造成刺激，引起疼痛。另外，长期压力和焦虑的情绪会导致口腔肌肉紧张，使疼痛的症状加重。建议清淡饮食，多喝水，保持心情愉悦，症状一般会逐渐缓解。
二、疾病因素
1、过敏：如果对皮蛋有过敏反应，食用后可能会引起过敏症状，出现舌头两侧疼痛、红肿等不适症状。建议远离致敏物质，可以遵医嘱服用抗过敏药物治疗，常用药物有盐酸依匹斯汀片、氯雷他定胶囊、马来酸氯苯那敏片等，有助于缓解过敏引起的不适症状。
2、细菌感染：如果皮蛋保存不当或者没有彻底煮熟，可能存在细菌，食用后容易导致口腔感染，引起舌头疼痛、肿胀等症状。建议在医生的指导下服用抗生素治疗，常用药物有阿莫西林胶囊、头孢克洛胶囊、头孢氨苄胶囊等。
此外，还可能是口腔溃疡、舌炎、舌乳头炎等原因导致，建议到医院就诊，在医生的指导下做详细检查，明确病因。