药流三个月了月经过后不规则出血可能是排卵期出血、宫颈炎、异常子宫出血等原因引起，需要针对引发的原因采取治疗措施。
1、排卵期出血：可能是因为月经结束之后进入排卵期，体内的激素水平发生明显的变化，子宫内膜失去激素的支撑，促使内膜发生些许的剥脱，引起阴道部位有少量出血。通常是不需要特殊治疗的，做好外阴部位的卫生和护理措施即可。
2、宫颈炎：可能是病原微生物入侵宫颈组织，导致宫颈黏膜受损，破坏宫颈部位的血管供应系统，引起异常出血、腹部疼痛、白带增多等症状。可以遵照医嘱服用甲硝唑片、替硝唑片等药物治疗。
3、异常子宫出血：可能是排卵障碍或子宫内膜局部异常，对子宫内膜造成刺激，使子宫内膜不断增殖，引起子宫内膜不规则剥脱，诱发异常出血。可遵照医嘱服用地屈孕酮片、左炔诺孕酮片等药物治疗。
除此之外，还有可能是子宫内膜炎、宫颈息肉、子宫肌瘤等原因引起，具体需要前往医院完善相关检查。