5-羟吲哚乙酸通常是用于检测类癌综合征。
5-羟吲哚乙酸是血清素当中的主要代谢产物，通常会伴随着尿液一起排出体外，临床上用于监测或者诊断类癌综合征。类癌综合征是由高分化神经内分泌肿瘤所产生的活性物质，比如激肽释放酶、组胺、5-羟色胺、缓激肽以及前列腺素等引起的头晕、腹泻、皮肤潮红、心脏病变等综合征。临床上通常使用5-羟吲哚乙酸来诊断该疾病，若在检测的过程中发现数值明显高于正常的范围值，可以提示类癌综合征。
如果检查的过程当中出现异常结果，还需要进一步完善五肽胃泌素激发试验、类癌肿瘤组织5-HT检测，确定后再针对病变部位采取手术治疗，防止病情进一步发展。