精子畸形重度一般与环境因素、药物因素、精索静脉曲张、前列腺炎、前列腺增生等原因有关，通常需要根据原因进行处理。
1、环境因素：如果长时间在高温环境下生活，或者长期接触杀虫剂、重金属等物品，容易对精子质量造成影响，长期可出现重度畸形现象。通常建议患者改善不良的生活环境，如保持生活、工作环境温湿度适宜，避免接触有害、有毒的气体和物质，或遵医嘱口服维生素C片、维生素E片等药物来改善。
2、药物因素：长时间大剂量使用雌激素类药物，如戊酸雌二醇片、己烯雌酚片等，其药物成分容易造成机体内分泌失调，增加精子畸形的几率。通常需要及时停止相关药物的服用，并遵医嘱选择左卡尼汀口服溶液、辅酶Q10胶囊等药物，有利于改善睾丸循环，提高精子质量。
3、精索静脉曲张：通常是因为静脉瓣膜功能不全、静脉回流障碍等原因导致，症状严重者可表现为患侧阴囊增大，并伴有精子质量下降。一旦确诊，可行精索静脉结扎手术，并在手术后遵医嘱服用抗菌消炎的药物，预防伤口出现感染，常见药物包括红霉素肠溶片、青霉素V钾片等。
4、前列腺炎：如果患者的前列腺部位长期受到炎症刺激，容易导致前列腺分泌功能异常改变，影响精子的质量，表现为精子畸形。一般需要遵医嘱选择甲磺酸多沙唑嗪缓释片、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物来治疗。
5、前列腺增生：通常是细胞增殖与凋亡失衡引起，若疾病持续发展，容易导致前列腺液分泌减少，从而使精子数量减少，干扰精子的活动度，诱发精子畸形率升高。可在医生指导下选择非那雄胺片、盐酸酚苄明片等药物改善。
临床上引起此情况的原因较多，具体还需前往医院就诊，由专业医生诊治。