剩米饭食物中毒的致病菌有金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌属等。
1、金黄色葡萄球菌：金黄色葡萄球菌是一种革兰氏染色阳性球型细菌，通常会在剩饭或者米面中滋生。若剩米饭存放的时间过长，滋生较多的金黄色葡萄球菌，会对胃肠道组织造成刺激，增加食物中毒的发生概率。
2、大肠杆菌：多数是因为米饭存储的方式不当，滋生较多的大肠杆菌。该种病菌进入肠道组织后，会产生较多的毒素，诱发肠黏膜出现炎症反应，表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻等不适症状。
3、沙门氏菌属：也有可能会滋生沙门氏菌属，致病菌产生的细菌和毒素进入人体之后，都会对胃肠道造成影响，引发食物中毒反应。
除此之外，也有可能是蜡样芽胞杆菌、溶血性细菌、肉毒杆菌等。一旦出现食物中毒症状，应前往医院就医，及时进行催吐或者洗胃治疗。