褪黑素是否影响长高，目前研究尚无定论，但理论上褪黑素和生长激素的分泌有一定关系，若遵医嘱使用，一般不会对身高产生影响，若过量服用可能会影响长高。
褪黑素是人体的重要激素，其分泌的表现为昼夜节律性，夜幕降临时开始分泌，可影响到睡眠。而长高和生长激素的分泌有密不可分的关系，生长激素主要是在夜间深度睡眠时分泌。患者在医生的指导下合理应用褪黑素，有利于帮助人体进入深度睡眠，此种情况下，不仅不会影响到长高，反而对于身高的增长有促进作用。
但若过量服用褪黑素，可能会出现睡眠功能紊乱，从而影响到生长激素的分泌。生长激素分泌过多或者是过少，均有可能会对身高产生影响。由于青少年人群正在生长发育阶段，并不建议随意、盲目服用，以免对正常生长发育产生影响，如存在适应症，需在医生的指导下使用。