肛门腺开口位于肛管直肠交界处的肛窦内，肛窦呈漏斗状向上开口，当受到损伤、细菌等侵入时，可引发感染。患者可在医生的指导下用甲硝唑栓、红霉素软膏、阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片、甲硝唑片等药物治疗。
1、甲硝唑栓：甲硝唑栓对缺氧情况下生长的细菌和厌氧菌有一定的杀灭作用，可以抑制细菌脱氧核酸的合成，能够干扰到细菌的生长和繁殖。症状比较轻微的肛门腺感染患者可遵医嘱进行局部治疗。
2、红霉素软膏：红霉素软膏属于大环内酯类抗生素，对多数革兰阳性菌、部分革兰阴性菌等有一定的抗菌活性，可在医生的指导下对感染处进行涂抹。
3、阿莫西林胶囊：阿莫西林胶囊属于广谱青霉素类抗生素，具有消炎的作用，适用于敏感菌导致的肛门腺感染，比如大肠埃希菌、奇异变形杆菌或粪肠球菌等。
4、头孢呋辛酯片：可以起到杀菌的作用，其作用原理是通过结合细菌蛋白，从而抑制细菌细胞壁的合成，可用于治疗大肠杆菌或肺炎克雷伯菌引起的单纯性肛门腺感染。
5、甲硝唑片：甲硝唑片具有较强的抗菌作用，可用于治疗敏感菌引起的皮肤软组织或生殖系统感染。
一旦出现肛门腺感染要保持个人卫生，内裤要经常换洗，并且要严格遵医嘱使用药物治疗，定期到医院进行复查。