三岁儿子长阴毛通常是性早熟表现，可能与饮食不当、化妆品刺激、先天发育异常、脑膜炎、脑炎等因素有关，需由专业医生诊断处理。
1、饮食不当：性早熟是儿童生长发育异常的内分泌疾病，患者会出现身高体重过快增长、阴毛、腋毛过早生长等症状，部分患者还会伴有头痛、视力减退等现象。该疾病的发生可能是经常吃反季水果、含添加剂成分等食物，导致机体性激素水平升高，诱发性早熟的症状。应调整健康的饮食结构，避免加重不适症状。
2、化妆品刺激：如果孩子经常接触大人的化妆品，化妆品刺激可能会导致体内激素水平发生异常，增加该疾病的发生率。大人应选择温和不刺激的化妆品，同时尽量将化妆品放置孩子接触不到的地方，防止对身体造成进一步伤害。
3、先天发育异常：如果下丘脑-垂体-性腺轴功能发育异常，可能会对激素分泌产生影响，引起性早熟的情况。需要在医生指导下服用炔雌醇环丙孕酮片、醋酸甲羟孕酮片、甲磺酸溴隐亭片等药物进行治疗。
4、脑膜炎：是因细菌、病毒、真菌等入侵脑膜部位引起的炎性病变，炎性刺激可能会影响中枢神经系统，导致出现性早熟现象，还会伴有发热、头痛、颈部僵硬等病症。可遵医嘱使用阿昔洛韦片、布洛芬颗粒、头孢克肟颗粒等药物治疗。
5、脑炎：与免疫力低下、病原体感染等因素有关，导致中枢神经系统发生异常免疫反应，引发性早熟，同时还会表现出发热、呕吐、精神行为异常等现象。应配合医生口服利巴韦林颗粒、对乙酰氨基酚颗粒、更昔洛韦分散片等药物。
生活中家长应指导患儿多吃富含维生素以及高蛋白质的食物，减少电子产品的使用，发现有性早熟表现时，需尽早前往医院就诊，对因治疗。