母乳性黄疸主要发生在以母乳喂养为主的新生儿当中，具体发病机制尚不明确，目前大多数认为可能和遗传以及胆红素肠肝循环增加的因素有关。
1、遗传：部分研究显示，出现母乳性黄疸现象，很有可能和肝脏先天性能力不足有关，肝脏能力下降后可能无法有效处理多余的胆红素。
2、胆红素肠肝循环增加：也有一些研究显示，母乳性黄疸新生儿所吃的母乳当中发现了存在着较高的β-葡萄糖醛酸酐酶水平，该物质能够促进肠道再次吸收没有被结合的胆红素，增加肝脏处理负担，从而诱发疾病。
无论哪种原因引起，确诊之后需要积极配合医生治疗，避免治疗不及时影响身体健康。