小拇指指腹隐隐作痛可能是外伤、甲沟炎、脓性指头炎、类风湿性关节炎、痛风性关节炎等原因引起，针对原因采取处理措施。
1、外伤：可能是小拇指指腹部位遭受到挤压伤、针刺伤，造成局部的软组织受损，表现为刺痛、灼痛等。局部的护理措施，软组织修复之后疼痛症状会逐渐消失。
2、甲沟炎：多数是经常过度修剪指甲，导致细菌入侵甲构组织引起的炎症反应，炎性因子刺激到周围的痛觉神经，会出现肿胀和疼痛症状。可在医生的指导下涂抹红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗。
3、脓性指头炎：多数是由刺伤或者甲沟炎加重，导致手指末梢的指腹皮下软组织出现化脓性感染，表现为肿胀、疼痛等。应在医生的指导下服用甲硝唑片、替硝唑片等药物消炎治疗。
4、类风湿关节炎：是由环境因素或者遗传因素共同作用，引起的自身免疫性疾病，病变累及至小拇指关节，对周围的组织造成破坏，表现为活动受限、疼痛等。需要在医生的指导下服用甲氨蝶呤片、来氟米特片等药物改善。
5、痛风性关节炎：可能是因为体内的尿酸盐结晶，沉积在软骨、关节囊、骨质部位引起的炎症反应，表现为关节疼痛、红肿等。应在医生的指导下给予秋水仙碱片、非布司他片等药物缓解。
患者要做好局部的卫生和护理措施，短时间尽量不要用手抓挠，防止皮肤破损。如果症状持续不能恢复，还需要及时前往医院完善相关检查。