肩胛骨痛了五六年了可能和过度劳累、不良姿势等有关，也可能是外伤、肩周炎、颈椎病等原因引起，引起原因不同，处理方法也不同。
1、过度劳累：如果经常从事体力劳动或剧烈运动，肩胛骨肌肉被反复、长期牵拉，容易发生肌肉劳损，导致充血、水肿和疼痛。平时要注意劳逸结合，适当休息，局部热敷可得到逐步缓解。
2、不良姿势：长期保持一个姿势，比如趴着睡觉、长赶时间低头伏案工作等，容易导致肌肉疲劳，影响局部血液循环，导致血流不畅，引发肩胛骨疼痛。注意纠正不良姿势，适当加强锻炼以缓解不适。
3、外伤：肩胛骨受到撞击、磕碰等外伤，可发生骨折情况，引起局部肿胀和疼痛。可在医生指导下进行牵引治疗或手法复位，必要时配合医生进行手术治疗。
4、肩周炎：属于无菌性炎症疾病，发病机制暂不明确，由于肩盂肱关节囊炎性粘连，可引起肩部疼痛、僵硬、活动受限等症状。可遵医嘱服用对乙酰氨基酚片、布洛芬片等药物缓解。
5、颈椎病：主要由颈椎椎间盘退行性变引起，表现出枕、颈、肩、背部酸胀、疼痛、发僵等症状。平时注意调整姿势，加强腰背肌锻炼，必要时在医生指导下通过头颈牵引、手法治疗等方法治疗，或配合医生手术治疗，常用手术方法包括颈椎前路减压融合术、颈椎前路减压融合术等。
建议及时前往医院明确引起原因，如果确因疾病引起，配合医生积极治疗。在此期间要减少活动，适当休息，有利于身体尽快康复。