宝宝手指甲脚趾甲两层可能和长期接触有机溶剂、营养不良、硬皮病、甲扁平苔藓、斑秃等因素有关。
1、长期接触有机溶剂：该不良习惯可能会破坏组织细胞之间的粘合力，从而出现上述情况。
2、营养不良：可能和毛发硫营养不良的遗传性疾病有关，该疾病可能会造成参与角蛋白合成的酶缺陷，从而出现甲营养不良的现象，可能会导致指甲分层。
3、硬皮病：具体病因并不是很明确，可能和遗传、感染等因素有关，该疾病会影响机体正常循环，出现障碍后可影响甲母质正常功能，引起缺陷。
4、甲扁平苔藓：是一种炎症皮肤疾病，可能是遗传、感染、免疫力低下等因素引起的，可造成皮肤以及指甲损害，
5、斑秃：患者主要症状表现为斑片状脱发，严重时可累及甲母质，从而出现甲板粗糙、分层等现象。
建议家长带宝宝前往医院完善相关检查，如果确实和疾病因素有关，尽快配合医生治疗。