手足口病疹子变成水疱了可能是正常恢复现象，也可能是由药物过敏所致，也可能与单纯疱疹、湿疹、虫咬皮炎等因素有关，具体需结合自身状况进行诊治。
1、正常恢复：疹子是手足口病常见症状，恢复过程中疹子可能会变成水疱，溃烂结痂，是一种正常的恢复现象。无需特殊治疗，恢复期间注意饮食清淡，多饮用热水，有助于病情恢复。
2、药物过敏：治疗手足口病期间，如果患者对某些药物过敏，出现过敏反应后也会有疹子变成水疱的现象。此时应立即停止用药，注意保证皮肤清洁，适量饮水促进新陈代谢，可有效缓解不适症状。
3、单纯疱疹：患病期间由于自身抵抗力较差，可能会引发疱疹并发症状，常表现为红斑状的小水疱，并伴随疼痛症状。此时患者需遵医嘱阿洛昔韦片、甲钴胺片等药物，有一定的疗效。
4、湿疹：湿疹是一种常见的皮肤炎症疾病，发生炎症反应时会出现水疱并伴随瘙痒症状。一般需要遵医嘱使用复方地塞米松乳膏、卤米松乳膏等药物进行治疗。
5、虫咬皮炎：患病期间蚊虫叮咬患处可能会产生过敏反应，常表现出红斑、水疱等症状。及时清洗患处并在医生指导下使用清凉油、硝酸咪康唑乳膏等药物，有一定的缓解作用。
手足口病患者应注意个人卫生，饮食清淡，需遵医嘱用药。恢复期间出现不良反应后及时就医诊治。