婴儿心脏和肺不好是否能做肛门手术取决于实际情况，如果病情比较轻微症的医生同意后可以手术，严重的情况下可能做不了手术。
部分婴儿刚出生时免疫力相对比较低下，心脏和肺功能可能稍微有点差，如果需要做肛门手术，可以配合医生对婴儿身体健康状况进行全面评估，如果手术风险不大，也存在可以做手术的可能性。但如果婴儿存在先天性心脏病、重症肺炎等比较严重的疾病，可能会有心血管异常、肺功能受损等多种症状，此时手术风险较大，不利于健康，如果并不是很着急，一般不建议手术。
出现上述情况后家长应尽快配合医生将心脏和肺部的问题解决，有利于身体健康。