新生儿肚脐进水后及时清理，一般不会引起危害。如果清理不及时，可能会引起感染的危害。
如果家长在给新生儿洗澡的时候，不小心导致肚脐部位进了水，及时给予干燥处理，一般不会引起明显的不适症状，所以通常是没有危害的。
但如果新生儿肚脐进水了之后，没有及时给予规范性处理或者处理不及时，容易导致少量水分在肚脐部位停留，使肚脐部位处于潮湿的环境，进而增加细菌生长繁殖的几率，导致局部出现红肿、渗出等感染的情况，严重时还可能会引起脐炎。
家长在照看新生儿的时候要在专业医师的指导下小心呵护，当新生儿出现异常情况的时候，需要及时到当地正规医院接受规范性治疗，以免耽误病情。