12岁男孩半夜起来乱跑可能和作息不规律、环境不佳、做梦、缺钙、偏头痛等因素有关。
1、作息不规律：12岁男孩长时间熬夜或者日常作息时间颠倒，容易剥夺夜晚睡觉时间，导致夜晚精神亢奋，出现乱跑的情况。
2、环境不佳：如果男孩睡觉的环境欠佳，如温度过高、噪音过大等，容易对正常睡眠造成影响，导致半夜起来乱跑。
3、做梦：男孩睡觉的过程中如果做了噩梦，容易因为心里不安，而到处乱跑寻求大人的安慰。
4、缺钙：饮食不规律或者挑食、偏食等不良的行为，容易导致体内钙元素严重缺乏，使神经系统处于兴奋状态，引起睡眠不安稳、睡眠时间短等症状。
5、偏头痛：是一种常见反复发作的头部疾患，主要表现为头部一侧或者双侧出现搏动性的剧烈疼痛，引起原因尚不完全明确，可在任何时间段发作，使男孩不能正常的睡眠。
家长要让男孩养成良好的生活习惯，保证规律作息，同时还要营造良好睡眠环境。当男孩身体状况出现异常情况时，还要及时就医处理。