女性甲状腺过氧化物酶抗体高1000IU/ml，属于阳性的检查结果，可能和遗传、高血脂症、原发性甲状腺功能减退、甲状腺功能亢进症、系统性红斑狼疮等原因有关，需要根据引起的原因给予对应的处理措施。
1、遗传：如果父母的甲状腺过氧化物酶抗体高，受到遗传因素影响时，自身的数值也会有所偏高。其机制尚不明确，尚无明确的规避方法。
2、高血脂症：高脂血症在发生后可能会破坏内皮细胞的功能与结构，造成肝功能损伤后也可引起甲状腺过氧化物酶抗体高，在平时会出现胸痛、胸闷等症状。明确诊断后需要减少胆固醇和饱和脂肪酸的摄入量，还可在医生指导下给予普罗布考片、苯扎贝特片等药物进行治疗。
3、原发性甲状腺功能减退：受到甲状腺功能异常的因素影响后，也可能会导致抗体检查阳性，还可伴随畏寒、乏力等现象。可在医生指导下给予左旋甲状腺素钠片、甲状腺片等药物进行治疗。
4、甲状腺功能亢进症：甲状腺功能过强时，在进行检查的过程中也有可能会导致抗体结果异常，在平时还可伴随心慌、手抖等现象。可在医生指导下给予甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶片等药物治疗。
5、系统性红斑狼疮：系统性红斑狼疮在发生发展的过程中，可能会导致产生多个脏器受到损伤，引起自身免疫受损害时，会产生抗体阳性的检查结果。可在医生指导下给予醋酸氟轻松乳膏、丙酸倍氯米松乳膏等药物进行治疗。
如果在检查时出现异常现象，需要在专业医生指导下完善相关检查，明确具体因素后及时进行有效治疗。