紫草软膏进入宝宝眼睛里眼睛都肿了可能和使用不当、药物刺激、过敏反应、感染、自身疾病等原因有关，需要根据具体情况进行相关处理。
1、使用不当：如果在使用紫草软膏时，不慎将药膏涂抹到眼睛里，由于眼部组织较为敏感，可能会引起局部刺激，导致眼睛肿胀。可以用清水清洗缓解症状。
2、药物刺激：如果宝宝在涂抹紫草膏后，没有及时清洗或受到外界环境的影响，也可能导致眼睛受到刺激，引起眼睛肿胀。可在医生指导下使用生理氯化钠溶液进行清洗，并对局部进行冷敷，有利于消除肿胀。
3、过敏反应：宝宝可能对紫草软膏中的某些成分产生过敏反应，导致眼睛红肿、痒或出现其他过敏症状。可以使用盐酸赛庚啶乳膏、盐酸多塞平乳膏等药膏涂抹。
4、感染：如果紫草软膏进入宝宝眼睛后引起感染，也可能导致眼睛肿胀。通常会伴有眼部发红、分泌物增多、疼痛或有渗出物等症状。可使用红霉素软膏或氧氟沙星滴眼液等药物治疗。
5、自身疾病：如果宝宝之前已经患有眼部疾病，比如细菌性角膜炎，可能会导致眼睛发红、肿胀、流眼泪等。可在医生指导下使用妥布霉素滴眼液、氯霉素滴眼液等药物治疗。
平时要做好眼睛的保护，避免让宝宝用手去揉眼睛，如果眼睛出现异常问题，要及时到医院就诊。