羊水穿刺染色体异常通常代表胎儿有异常疾病，胎儿能不能要需根据染色体的异常程度和夫妻双方的自身意愿考虑。
如果染色体异常的程度比较严重，比如5号染色体异常，患儿临床上称为小儿猫叫综合征，胎儿的智力、听力、骨骼、内脏等发育都有一定影响，目前临床上没有较好的治疗方法，多数患儿会在儿童期因为心力衰竭、呼吸衰竭等死亡。因此染色体异常情况比较严重的胎儿即使生下来起成活率也是比较低的，一般医生不建议要。
但是某些染色体异常现象只对胎儿的智力有影响，胎儿的其他方面可以正常发育，比如小儿唐氏综合征患儿出生后大多可以通过康复治疗，掌握基本自理能力，如果夫妻双方表现出强烈要此胎儿的意愿，医生通常也不会过多干预。
建议有此异常情况时要和医生积极沟通，根据胎儿的实际情况决定是否要此胎儿，如果情况比较严重，应该听从医生建议处理。