16岁月经停经几个月了考虑跟体内激素变化、药物副作用、肥胖、月经不调、多囊卵巢综合征等因素有关，需要在医生的指导下积极进行治疗。
1、体内激素变化：青春期女性的体内激素水平会发生明显变化，尤其是雌激素和孕激素水平，若体内激素紊乱会直接影响子宫内膜的生长、脱落，因此会出现停经好几个月的情况，一般比较正常，基本上不必治疗，后期可能会逐渐恢复。
2、药物副作用：一些药物可能会影响月经周期，例如抗抑郁药、抗过敏药等。如果正在服用这些药物，可能会出现月经不规律的情况，需要咨询医生判断是否停止用药。
3、肥胖：体重过重可能会影响月经周期，肥胖的女性更容易出现月经不规律、月经推迟或停经等问题。需要适当进行体育运动，减少油脂类食物的摄入。
4、月经不调：如果体内激素分泌紊乱，内分泌失调，可能会直接影响到子宫内膜的生长脱落，从而出现月经不调，可以在医生指导下使用戊酸雌二醇片、乌鸡白凤丸、益母草颗粒等药物治疗。
5、多囊卵巢综合征：若受到遗传因素影响或内分泌异常，可能会诱发多囊卵巢综合征，产生月经稀发、月经停止、多毛、痤疮等症状，建议在医生指导下使用炔雌醇环丙孕酮片、地屈孕酮片、氯米芬片等药物治疗，严重时可能需要进行手术治疗，包括腹腔镜卵巢楔形切除术、腹腔镜下卵巢打孔术等。
平时需要多关注个人身体情况，如果有月经异常的症状出现，需要及时就医，同时还需保持良好的饮食习惯，清淡饮食。