上下牙重合会不会不舒服需根据个人身体情况判断。如果咬合正常，一般不会不舒服；若咬合不正或出现其他牙齿问题可能会不舒服。
如果上下牙重合情况并不严重，是正常咬合，没有影响到日常咀嚼。这种情况一般不会对个人身体造成较大影响，导致不适症状出现，因此基本上不会有不舒服的情况产生，平时需多注意观察个人身体情况，保持良好的饮食习惯。
但如果上下牙重合情况比较严重，已经出现了明显的咬合不正，这种情况可能不太舒服，咬合过程中可能会出现牙齿磨损、口腔黏膜损伤症状。上下牙重合时间过长可能会对牙齿造成影响，导致牙周病出现，因此也会不太舒服。如果上下牙重合时间过长或用力过猛，可能会导致肌肉疲劳的情况。
平时需观察个人身体情况，若有明显不适需要及时就医进行相关调理治疗。