第五跖骨基底部骨折21天还痛可能是骨折未愈合、剧烈运动、治疗效果不佳、局部感染、二次损伤等原因造成的。可到医院进行相关检查，明确原因，针对引起的原因选择合适的方法改善。
1、骨折未愈合：第五跖骨基底部骨折需要一定的时间恢复，一般21天骨折未完全愈合，骨头没有长好，就可能会出现疼痛的现象。通常可进行适当的康复训练，促进骨折部位愈合。
2、剧烈运动：如果在骨折恢复期间，过早剧烈运动，可能会对骨折部位产生牵拉，引起疼痛。建议卧床休息，避免剧烈运动，导致疼痛加重。如果疼痛比较严重，可以在医生的指导下使用药物减轻疼痛，常用的药物有塞来昔布胶囊、依托考昔片、美洛昔康片等。
3、治疗效果不佳：如果骨折的治疗效果不佳，比如固定不牢固、对位不准确等，可能会导致骨折部位的愈合不良引起疼痛。建议由医生进行重新固定、重新对位，促进骨折愈合。
4、局部感染：如果骨折部位出现感染，可能会导致炎症反应，刺激周围的神经和组织，导致疼痛。保持伤口的清洁和干燥，避免感染加重，还可遵医嘱使用药物，减轻炎症反应，常用的药物有洛索洛芬钠片、布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等。
5、二次损伤：如果在恢复期间再次受伤，可能会导致骨折部位的再次损伤，引起疼痛。可在医生的指导下，重新评估骨折的治疗方案，进行重新固定或手术治疗。
日常可适当进行热敷、中药泡脚等方法，促进血液循环和组织愈合。