小儿慢性结肠炎可以在医生指导下服用蒙脱石散、阿奇霉素颗粒、复方黄连素片、肠炎宁片、肠康片等药物治疗。
1、蒙脱石散：药物中含有蒙脱石，具有较强的吸附力，能够将肠道内的病毒、细菌、毒素等物质吸附，随着大便排出体外，缓解疾病引起的腹痛、腹泻。
2、阿奇霉素颗粒：该药物是氮杂内酯类抗生素，主要成分是阿奇霉素，进入体内能够抑制细菌蛋白质的合成，减轻炎症反应，缓解慢性结肠炎引起的里急后重、便血等表现。
3、复方黄连素片：由盐酸小檗碱、木香、吴茱萸等成分制成，具有清热燥湿、行气止痛、止痢止泻等功效，能够改善疾病引起的炎症反应，促进肠道黏膜修复和再生，使病情得到控制。
4、肠炎宁片：由地锦草、金毛耳草、樟树根等成分组成，具有清热利湿、行气的功效，可以改善慢性结肠炎引起的腹泻、肛门灼热等症状。
5、肠康片：是由盐酸小檗碱、木香、吴茱萸（制）等成分制作而成，可以起到清热燥湿、理气止痛的功效，能够减轻肠道黏膜炎症反应，帮助缓解腹痛、腹泻等症状。
建议饮食上尽量保持清淡，避免吃辛辣刺激或生冷性食物，同时多喝水，多休息，避免病情加重。