野生型胃肠间质瘤的主要发病原因与基因突变有关，通常需要前往医院，根据个人情况采取针对性治疗措施。
有些胃间质瘤，通过检查发现不存在C-KIT基因突变，也不存在PDGFR-A基因突变，临床上将其称作为野生型胃肠间质瘤。这种疾病的发病机制不是很明确，研究表明可能与基因发生突变有关，常见症状包括胃肠道出血、腹痛、腹部有包块。如果伴随恶变，还可能会出现体重减轻、发热等现象。
一般在确诊疾病后，对于良性患者，可及时采取根治性手术方法进行治疗，对于存在恶变的患者，可配合放疗、化疗、免疫治疗等治疗方法综合治疗，来提高患者的生活质量。