一般没有甲状腺肿大挂什么科室最好的说法，但是可在医生指导下挂内分泌科、普外科、甲状腺外科、肿瘤科、急诊科等。甲状腺肿大可能与自身免疫因素、碘元素缺乏等有关。根据各科室的相关检查明确具体病因，在医生指导下进行对症处理。
1、内分泌科：此科室主要用于检查及治疗代谢方面的疾病，甲状腺肿大可能是机体缺乏碘元素或者碘元素过多生成所导致，建议患者到此科室就诊。
2、普外科：主要治疗普通的外科疾病，如果患者只是甲状腺肿大，到此科室挂诊，一般可以得到有效治疗。
3、甲状腺外科：此科室主要治疗关于甲状腺方面的疾病，例如甲状腺肿大、甲状腺瘤、甲状腺炎等。
4、肿瘤科：如果患者甲状腺肿大是肿瘤压迫所导致，建议到此科室就诊，方便查明病因。
5、急诊科：主要处理急诊病人，如果患者是在夜间发现甲状腺有明显肿大，并且引起呼吸困难，可以到此科室就诊处理，避免病情恶化。
患者可结合自身状况选择合适的科室，如果查明原因后，要积极配合医生进行相关治疗。