12岁女孩内裤上有棕褐色的分泌物可能是卫生不佳、月经初潮、阴道炎、肛裂、痔疮等原因引起。建议家长带女孩前往医院完善相关检查，明确引起的原因后再采取处理措施。
1、卫生不佳：可能是因为女孩平时的卫生习惯不是特别好，比如没有用温水清洗外阴部位或者内裤不经常更换，导致较多的尿液在内裤上残留，形成褐色样改变。
2、月经初潮：12岁的女孩已经进入青春期，随着卵巢功能的逐渐发育，可能会出现月经来潮的情况，由于刚开始的月经量比较少，因此会出现褐色的分泌物。
3、阴道炎：可能是因为平时过度清洁阴道部位，导致阴道当中的菌群紊乱，病原微生物繁殖后引起炎症反应，周围的毛细血管破裂，使血液混合在分泌物当中排出，同时还伴有外阴瘙痒。
4、肛裂：可能是不良的饮食习惯或者是外伤，导致肛门部位的黏膜组织损伤，促使少量的血液混合在粪便当中，堆积在内裤上，形成褐色改变。
5、痔疮：如果女孩本身患有痔疮，排便的过程当中，对于周围的黏膜组织造成刺激，诱发黏膜溃烂，也会使少量的血液混合在粪便中，堆积在内裤上面。
平时要做好女孩的防护措施，每天晚上使用温水清洗外阴部位，保持局部的清洁和干燥，内裤也要经常更换。