孕晚期通常是指妊娠晚期，此时肛门疼可能是胎儿压迫神经、胎儿入盆、痔、便秘、肛裂等原因导致，应该及时前往医院就诊，配合医生进行相关检查后针对治疗。
1、胎儿压迫神经：妊娠晚期胎儿个体较大，可能会对盆腔和下肢神经产生压迫，从而出现肛门坠胀感、肛门疼痛、下肢麻木等现象。
2、胎儿入盆：在妊娠晚期胎儿会为出生做准备，逐渐会以全身蜷缩姿势进入母体骨盆腔，孕妇通常会出现尿频、腰腿疼痛、肛门坠痛等症状。
3、痔：是妊娠期常见的病症，主要是胎儿压迫肠道导致肠管和直肠下端静脉充血形成，患者容易出现肛周瘙痒、肛门胀满感、肛门疼痛等症状。
4、便秘：是临床上常见的一种病症，与低纤维饮食、运动量过少、饮水量不足等因素有关，妊娠期女性由于胎儿对腹腔脏器挤压会经常出现该现象，同时伴随下腹部胀痛、肛门疼痛、食欲下降等症状。
5、肛裂：常见肛管后正中部位出现撕裂或破裂情况，与感染、长期便秘或腹泻、外伤等均有关系，患者通常会有肛门疼痛、便血、肛门瘙痒等现象发生。
妊娠晚期女性应该适当注意调整饮食结构，多吃新鲜苹果、香蕉、芹菜等膳食纤维和维生素丰富的食物，可以减少因肠道蠕动变慢而出现的肛门疼痛现象。