耳根流脓水的处理方法需要根据引起原因来判断，常见原因包括毛囊炎、外耳道炎、外耳道湿疹、中耳炎、外伤等。存在该现象的患者可以及时就医，由医生通过查体、耳镜等相关检查，明确病因，并制定合理的治疗方案，避免病情进一步加重。
1、毛囊炎：平时不注意耳根部位的清洁，容易导致大量细菌在毛囊口滋生，引起以毛囊为中心的丘疹、斑丘疹等皮损，皮损破裂时会有脓水流出，伴随红肿、疼痛等症状。需要做好局部皮肤的清洁，遵医嘱使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物处理。
2、外耳道炎：可能是脏水进入、不良挖耳习惯所引起的感染，炎症刺激通常会引起耳内分泌物增多、耳痒、耳痛等，分泌物流出时可导致耳根内有脓水。应注意外耳道的清洁，并在医生指导下规范性使用氧氟沙星滴耳液、氯霉素滴耳液等药物治疗。
3、外耳道湿疹：引起原因尚不完全明确，可能和食物刺激、精神因素等有关，可导致外耳道出现水疱、丘疹等皮损，皮损破裂后会有黄色分泌物流出，导致耳根部位有流液，伴随明显瘙痒症状。可在医生的配合下使用盐酸西替利嗪片、氯雷他定片等药物进行处理。
4、中耳炎：通常继发于上呼吸道感染、鼻窦炎等疾病，中耳黏膜受到炎症刺激会引起疼痛、耳鸣、脓性分泌物等，也会使耳根部位有脓水流出。可以在医生建议下口服阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行消炎治疗。
5、外伤：如指甲划伤、摩擦伤等外伤导致耳根部位出现伤口时，也会出现流脓水的情况，因为局部皮肤破损会促使血液以及渗出液排出，严重时还可能会继发感染，伴随明显疼痛症状。需要遵医嘱规范性使用莫匹罗星软膏、阿奇霉素分散片等药物治疗。
日常建议患者养成良好的卫生习惯，有耵聍形成时需要及时用掏耳勺或者棉签将其取出，不可以频繁使用手指挖耳朵，也不可以让脏水进入耳朵内，以免诱发感染。