12岁儿童头不由自主的抖动可能是不良习惯、营养元素缺乏、抽动症、特发性震颤、癫痫等原因引起，发生该现象时，应及时带领儿童就医，完善相关检查后由专业医生诊断，并采取相应方法治疗。
1、不良习惯：儿童模仿能力比较强，如果经常模仿他人做上述动作，久而久之可能形成习惯，出现无意识的头部抖动，家长应帮助儿童及时纠正。
2、营养元素缺乏：如果儿童平时比较挑食，导致维生素D或钙元素摄入不足，容易使植物神经兴奋性增高，从而出现一些特异性的表现，比如头部抖动、易激惹和烦躁等症状。可遵医嘱使用维生素D 滴剂、乳酸钙片等药物改善。
3、抽动症：属于一种神经精神障碍，可能和遗传、环境等因素有关，患者多个部位可发生运动性抽动，比如频繁眨眼、扭肩膀和抖头等，建议经医生指导使用氟哌啶醇片、氯硝西泮片等药物治疗。
4、特发性震颤：是一种比较常见的运动障碍疾病，可能与基因突变、环境等因素有关，患者会出现不自主的震颤，可发生在头、面和口等多部位。可在医生指导下使用盐酸普萘洛尔片、盐酸阿罗洛尔片等药物缓解。
5、癫痫：是一组脑部疾病，主要是脑部神经元异常放电引起，可导致中枢神经系统功能失常，从而使患者出现肌肉僵硬、不自主抽动和全身潮红等症状。建议遵医嘱使用卡马西平片、苯妥英钠片等药物治疗，严重时需要配合医生通过局部皮质切除术和大脑半球切除术等方法治疗。
生活中家长要帮助儿童养成良好的生活习惯，避免熬夜，适当加强体育锻炼，有助于提高免疫力。