巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，一般不会引起肛门坠胀。如果出现肛门坠胀的现象，建议患者到医院肛肠科门诊进行检查，明确具体情况，并根据检查结果，遵医嘱选择合适的方法缓解。
巧克力囊肿通常是在异位的子宫内膜在卵巢内生长，通常不会直接影响到肛门区域的神经和肌肉结构，因此不会引起肛门坠胀。但是由于异位子宫内膜组织在卵巢内生长，可能会影响卵巢的正常功能，导致患者出现痛经、性交疼痛、不孕等症状。
肛门坠胀可能是痔疮、肛裂、肛周脓肿等原因导致的，可根据具体原因，选择针对性的方法治疗。同时，保持肛门的清洁卫生，避免发生感染。