三个月宝宝鼻塞咳嗽可能是上呼吸道感染、病毒入侵、鼻炎、过敏、支气管炎等原因引起的，可以遵医嘱使用布洛芬混悬液、小儿氨酚黄那敏颗粒、四季抗病毒合剂、通窍鼻炎颗粒、氯雷他定糖浆等药物调整，建议及时到正规医院完善相关检查，然后再根据病因选择合适的用药。
1、上呼吸道感染：如果宝宝鼻塞咳嗽是上呼吸道感染引起的，可以使用小儿氨酚黄那敏颗粒治疗，有助于症状好转。
2、病毒入侵：宝宝在比较小的时候容易受到病毒入侵，会有鼻塞以及咳嗽的症状，使用四季抗病毒合剂，能够达到帮助病毒去除的效果。
3、鼻炎：可能是鼻窦黏膜受到细菌感染所引起的，会导致鼻窦黏膜充血和水肿，也会引起鼻塞、流鼻涕等症状，鼻涕分泌物反流到咽喉部位会产生刺激性咳嗽。需要遵医嘱使用通窍鼻炎颗粒治疗，具有消炎的作用。
4、过敏：如果鼻塞咳嗽与过敏因素有关系，可以使用氯雷他定糖浆，具有抗过敏效果。
5、支气管炎：三个月宝宝鼻塞咳嗽可能与支气管炎有关系，如果同时伴有发炎以及发热的症状，可以遵医嘱服用布洛芬混悬液有助于恢复。
患者在用药期间要定期到医院做复查，能够了解到病情的恢复情况，同时还需要多喝一些温水，可以及时补充体内所需的水分。