鼻窦炎可以在医生指导下应用抗生素类药物，抗组胺类药物、粘液促排剂、中药、糖皮质激素类药物以及白三烯受体拮抗剂等。需要注意的是不同原因引起的鼻窦炎用药也有一定区别，一定要按医嘱用药。
1、抗生素类药物：鼻窦炎多数是由于细菌、病毒感染所引起，可以在医生指导下首选头孢类抗生素，例如头孢克肟、头孢呋辛酯以及头孢曲松等，如果有合并厌氧菌感染，可以同时应用甲硝唑、替硝唑等进行治疗。
2、抗组胺类药物：鼻窦炎如果是由于过敏所引起，可以在医生指导下应用氯雷他定片以及西替利嗪片等。
3、粘液促排剂：鼻窦炎时会导致鼻腔有粘液脓液，可以在医生指导下应用桃金娘油以及桉柠蒎软胶囊等，可以促使鼻腔内粘液排出。
4、糖皮质激素类药物：一般属于局部用药，特别是对于合并支气管哮喘的鼻窦炎，可以在医生指导下应用糖皮质激素类药物，如糖酸莫米松鼻喷剂，可以改善局部炎症状态，加强引流。
5、中药：一般主要以清热解毒为主，例如鼻窦炎颗粒等。
6、白三烯受体拮抗剂：一般可以选择孟鲁司特进行治疗。
鼻窦炎如果迁延不愈或者是存在鼻腔鼻窦结构缺陷，一般可以通过手术进行改善，平时要戒烟戒酒，忌食辛辣刺激性食物。