肩胛骨囊肿一般是不能自愈的。建议患者应及时前往医院完善相关检查，明确病情严重程度后，积极配合医生进行治疗。
肩胛骨囊肿是发生在肩胛骨部位的一种良性病变，通常是因为周围的组织粘连，影响到肩胛骨部位的液体排出，造成较多的液体积聚之后，形成的囊肿样改变。由于疾病并不具备自限性，不会伴随着时间的推移或者是改善不良的生活习惯而自行消失，因此不能达到自愈目的。而且持续不及时采取相应的治疗，可能会促使病变组织逐渐增大，对周围的血管或者神经造成压迫，出现肩膀疼痛或者麻木。
患者平时要做好个人的防护措施，根据天气变化及时添减衣物，防止肩胛骨受到冷风刺激，必要时还可以在医生的指导下给予关节镜手术治疗，利用手术能够将病变组织切除。