六岁女宝宝尿道口疼痛可能和外伤、尿道口畸形、外阴炎、尿道炎、阴道炎、膀胱炎等原因有关，具体的情况建议带宝宝到医院进行相关检查，根据原因在医生的指导下对症处理。
1、外伤：宝宝在玩耍时如果尿道口不小心被锐器刺伤，可能引起局部疼痛、充血等。可在医生的指导下使用阿莫西林颗粒、头孢克肟颗粒等药物治疗。
2、尿道口畸形：有部分宝宝可能和胚胎因素、母体因素等原因有关，出生后有先天性尿道口畸形的情况，在排尿时可能会有疼痛的现象。需要带宝宝到医院进行检查，在医生的指导下进行手术矫正。
3、外阴炎：如果平时不注意宝宝的个人卫生护理，可能导致病原体感染，引起外阴的炎症反应，可出现外阴皮肤黏膜肿胀、疼痛、烧灼感等。可在医生的指导下使用一定比例的聚维酮碘溶液、高锰酸钾溶液进行坐浴，并做好卫生护理。
4、尿道炎：女宝宝尿道口比较短，排尿后没有及时清理，容易引起病原体感染，可出现尿道刺痒、尿道口疼痛等。可在医生指导下使用阿奇霉素颗粒、依托红霉素颗粒等药物治疗。
5、膀胱炎：通常是细菌感染引起，比如给宝宝擦拭大便时如果从后向前擦拭，容易造成大肠埃希菌的感染，表现为下腹疼痛、尿道口疼痛等。可在医生的指导下使用头孢呋辛酯颗粒、头孢克洛颗粒等药物治疗。
平时要做好女宝宝的卫生护理，内裤要经常清洗更换，不要和大人共同使用浴巾或洗澡盆。