扁平疣大多数可以在医生指导下使用水杨酸软膏、维A酸乳膏、转移因子胶囊、重组人干扰素α2b凝胶、盐酸伐昔洛韦片等药物治疗。扁平疣通常是人乳头瘤病毒感染引起的皮肤病，会导致皮肤上有扁平小丘疹，要及时就医，遵医嘱用药。
1、水杨酸软膏：遵医嘱使用后可以帮助扁平疣所引起的皮肤瘙痒症状得到减轻，是要皮肤病比较常用到的外部涂抹药膏。
2、维A酸乳膏：是治疗寻常痤疮或者扁平疣可以使用的药物，要听从医生指导，每天坚持涂抹在扁平疣的位置，有助于患者疾病逐渐有所好转。
3、转移因子胶囊：适合用于某些抗生素难以控制的病毒性感染疾病，比如出现了人乳头瘤病毒感染引起扁平疣，可以使用此药物有助于疾病症状减轻。
4、重组人干扰素α2b凝胶：能够起到抗病毒效果，也能抑制细胞增生和调节身体的免疫功能，对于扁平疣的恢复会有帮助。
5、盐酸伐昔洛韦片：抗病毒的效果比较好，扁平疣是受到人乳头瘤病毒感染造成的，用药之后可以促进疾病恢复。
扁平疣在治疗期间除了可以遵医嘱合理使用药物之外，也要做好饮食管理，吃优质蛋白食物，比如瘦肉和鸡蛋等，增强身体抵抗力。